严格执行《国务院关于坚决制止占用基本农田进行植树等行为的紧急通知》（国发明电20**1号，以下简称《紧急通知》）要求的保护基本农田“五个不准”，确保基本农田的规定用途不改变。绿色通道建设不得超出《紧急通知》规定的范围。基本农田上的农业结构调整应在种植业范围进行任何单位和个人不得签订在基本农田上造林的合同；不准在基本农田内挖塘养鱼和进行畜禽养殖，以及其他破坏耕作层的生产经营活动。已在基本农田上进行农业结构调整的，仍要按基本农田进行保护；对耕作层和农田基础设施造成破坏的，要限期恢复，确保基本农田数量不因农业结构调整而减少质量不因农业结构调整而减低。
进一步加大对违法违规骗取批准、占用和破坏基本农田行为的执法力度。对有令不行、有禁不止的，要按照《土地管理法》和《基本农田保护条例》有关规定坚决制止，责令纠正，情节严重的要从严查处，依法追究责任人的法律责任；构成犯罪的要依法追究刑事责任。
四、加大建设力度，切实提高基本农田质量
大力开展基本农田土地整理。各级政府投资的土地整理项目要向基本农田保护区，特别是国家粮食主产区（主产县）和商品粮基地的基本农田保护区倾斜，落实基本农田土地整理任务。基本农田土地整理新增加的耕地要划为基本农田。生态脆弱地区在对陡坡地和严重沙化地退耕的同时，要加大对平坝和缓坡耕地的整理力度，加大坡改梯、淤地坝以及对出现沙化趋势的耕地的建设和治理力度，使当地保有足够数量的基本口粮田。
加大基本农田质量建设力度。采取各种有效措施提高耕地产出水平，推广绿肥种植、秸秆还田技术，加大对使用有机肥料的支持力度，培肥基本农田地力；大力推广应用配方施肥、保护性耕作、地力培肥、退化耕地修复等技术，提升基本农田地力等级。加大对基本农田保护区农田水利建设的投入，改造和配套水利灌溉排水设施，增加基本农田的有效灌溉面积。
建立基本农田建设集中投入制度。加大公共财政对粮食主产区（主产县）和主要农业生产基地基本农田保护区建设的扶持力度；农田水利建设、农业综合开发、土地开发整理、耕地质量建设、农田林网建设等资金，按照地方政府统一规划、分步实施、部门管理、项目运作的原则，向基本农田保护区倾斜；制定扶持政策积极鼓励农民自愿出资出劳，建设高标准的基本农田，切实提高基本农田的生产能力。
五、开展动态监测，定期通报基本农田变化情况
完善基本农田保护基础性工作。省（区、市）、市（地）、县（市、区）、乡（镇）四级基本农田档案做到图件、数据齐备，可核可查，作为监督、检查、审核、补划、变更基本农田的依据。结合土地变更调查建立基本农田信息管理系统，准确掌握分析基本农田利用和变化情况。组织开展基本农田地力分等定级、土壤肥力和环境动态监测以及耕地地力调查与质量评价工作。结合耕地地力调查与质量评价建立基本农田质量档案。
加强基本农田的动态监管。建立省（区、市）、市（地）、县（市、区）、乡（镇）、行政村五级基本农田保护监管网络，开展动态巡查；开展基本农田动态监测和信息管理系统建设，利用卫星遥感手段，定期对基本农田保护区进行监测，重点对集中连片、优质高产以及城镇周边、交通沿线的基本农田保护区进行巡查和监测，及时发现、纠正和查处非法占用基本农田行为。完善耕地质量动态监测体系，及时掌握耕地质量变化状况，定期发布质量监测信息。各地每年要根据动态监管的结果，汇总基本农田保护情况，逐级上报。
建立基本农田保护定期通报制度。在各地动态监管的基础上，国土资源部、农业部定期对各省（区、市）基本农田保护情况和相关数据进行核查和通报，对问题突出的地区提出警示并督促整改，对基本农田没有达到土地利用总体规划确定的保护目标的要责令限期补划。
六、探索新机制，落实基本农田保护责任
按照《基本农田保护条例》的规定，建立基本农田保护责任制。将耕地和基本农田保护工作纳入政府领导任期目标考核的内容，签订责任书，明确由地方各级人民政府对土地利用总体规划确定的耕地保有量、基本农田保护面积和质量负责，定期进行目标考核并兑现奖惩措施。国土资源部门和农业部门及有关部门要按照部门职责，认真做好基本农田保护的有关工作，并注意调动社会各方面的积极性。以行政村为单位与乡级政府签订基本农田保护责任书，通过在土地证书和农村土地承包经营权证书标注的形式落实到承包农户，确认基本农田面积、位置和质量，明确承包农户保护基本农田的责任、权利和义务。
探索建立基本农田保护经济激励机制。国家和地方有关的农业补贴要向基本农田保护任务重的地区倾斜；国家投资土地开发整理项目和其他支农项目要向基本农田保护成效突出的地区倾斜。基本农田保护基础性工作、动态监测及信息系统建设和维护经费，按照有关规定，由同级财政部门在年度部门预算内统筹安排。对基本农田保护先进单位和个人要进行表彰和奖励。