（1）新办的非公有制企业的党组织，一般由县（市、区）镇、街道党（工）委属地管理，对规模较大的也可由市、县（市、区）的行业党委管理。相对集中在较大工业园区内的各非公有制企业党组织也可由工业园党组织管理。
（2）国有、集体企业转制重组为非公有制企业，其党组织关系原则上由行业主管部门党委或各系统党委管理;也可尊重出资者的选择划归属地管理。
（3）市、县（市、区）的社会组织党组织原则由行业主管部门党委或各系统党委管理。坚持“谁批准兴办，谁负责管理”的原则，确保不漏管，不重管。
3、规范设立党组织的审批程序。
（1）设立党的基层委员会的报批。属地管理的非公有制经济组织设立党的基层委员会，由企业提出申请，经所在镇、街道党（工）委审核后报县（市、区）委审批。非属地管理的非公有制经济组织设立党的基层委员会，属县（市、区）的，由企业提出申请，经主管部门党委或系统党委审核，报县（市、区）委审批；属市直的，由企业提出申请，经主管部门党委或系统党委审核，报市直机关工委审批，报市委组织部备案。
（2）设立党的总支部委员会（支部委员会）的报批。属地管理的非公有制经济组织设立党的总支部委员会（支部委员会），由企业提出申请，报镇、街道党（工）委审批。非属地管理的非公有制经济组织设立党的总支部委员会（支部委员会），由企业提出申请，分别报县（市、区）、市直主管部门党委或系统党委审批。
（3）社会组织设立党的基层委员会的报批。由社会组织提出申请，属县（市、区）的，经主管部门党委或系统党委审核，报县（市、区）委审批；属市直的，经主管部门党委或系统党委审核，报市直机关工委审批，报市委组织部备案。设立党的总支部委员会（支部委员会）的报批，由社会组织提出申请，分别报县（市、区）、市直主管部门党委或系统党委审批。
4、大力推行党建工作指导员和联络员制度。要不断推进向非公有制企业和社会组织选派党建工作指导员、联络员工作制度。党建工作指导员、联络员可以从党政机关、企事业单位、转业军人和部分退休老同志中挑选，在选派方式上要坚持因地制宜。对于部分规模较大的企业和社会组织，可以选派相对固定的党建工作指导员、联络员；规模较小的，可以由一名党建工作指导员、联络员负责联系若干家企业和社会组织。工作内容上要坚持指导与服务相结合。党建工作指导员、联络员既要成为帮助非公有制企业和社会组织组建党组织、发展新党员的指导员，又要成为在非公有制企业和社会组织学习贯彻“三个代表”重要思想的宣传员，还要成为帮助非公有制企业和社会组织解决难题的协调员。要加强对党建指导员、联络员的教育管理，不断提高指导员、联络员队伍的素质。对新成立的非公有制企业和社会组织党员人数少甚至无党员难以组建党组织的，要有计划地做好向非公有制企业和社会组织推荐、输送党员骨干的工作。
5、依托工会、共青团组织，促进党建工作的开展。要继续坚持“大党建”工作思路，把工会、共青团、妇女工作纳入党建工作范畴，按照有关法律和政策规定，积极做好群团组织的建立工作，加强党组织对群团组织的领导，确保党组织意图的实现和政治核心作用的发挥。对暂不具备建立党组织条件的非公有制企业和社会组织，先把工会、共青团等群众组织建立起来，通过加强对群众组织的领导开展党的工作，形成党团联动的党建工作运行机制,为企业和社会组织党员作用的发挥和组建党组织创造良好的群众基础和外部环境。
四、加强党组织自身建设，建立有效的约束、激励机制
1、加强党组织领导班子建设。要认真选配好党组织领导班子，特别是要选准配强党组织书记。应拓宽思路，选派政治素质好、组织能力较强、懂经营管理、有一定文化水平、善于做思想政治工作的党员生产经营骨干担任书记。企业和社会组织中没有合适书记人选的，可采取组织推荐、选派等双向选择的办法从非公有制企业外部物色合适人员逐步解决。党组织建设应与工会、共青团组织建设通盘考虑，工会主席可由党组织书记兼任，符合条件的团支部书记可进入党组织领导班子。要按一定比例，建立党务工作者后备干部队伍，进行跟踪培养。要高度重视非公有制企业和社会组织党务工作者业务能力的提高，各级党组织尤其是乡(镇)、县直系统党委每年要组织开展政治理论和专业技术培训，利用召开非公有制企业和社会组织党建工作座谈会、研讨会、交流会等形式，努力培养一支既懂经营管理知识，又熟悉党务工作，敬业爱岗的非公有制企业和社会组织党务工作者队伍。